Kauno r. Zapyškio pagrindinė mokykla organizuoja Lietuvos bendrojo ugdymo mokyklų 5-10 klasių mokinių respublikinį matematikos ir lietuvių kalbos nuotolinį konkursą “Uždavinys eilėraštyje”. Konkursas vyksta nuotoliniu

Minint tarptautinę Holokausto aukų atminimo dieną 2020-01-27 istorijos pamoka vyko Zapyškio žydų žudynių vietose.

Nacionalinė švietimo agentūra vykdo ES paramos projektą „Mokyklų aprūpinimas gamtos ir technologinių mokslų priemonėmis“. Projekte dalyvaujančias mokyklas pasiekė nupirktos mokymo priemonės ir įranga 5-8 kl.,